Tại vòng này, chỉ có 2 cặp đấu gồm Shirak (Armenia)-Tre Penne (San Marino) và Lusitanos (Andorra)-EB/Streymur (Đảo Faroe). Các đội này sẽ thi đấu 2 lượt trận để chọn ra đội vào vòng sơ loại thứ hai gồm 17 cặp đấu.

Các đội thắng ở vòng sơ loại thứ hai sẽ tiếp tục bước vào vòng sơ loại thứ 3 rồi vòng play-off tranh vé dự vòng đấu bảng Champions League 2013/14. Vòng play-off sẽ được tổ chức vào các ngày 20-21 (lượt đi) và 27-28 (lượt về) tháng 8.

Mùa giải Europa League cũng sẽ bắt đầu vào ngày 4/7 tới với loạt trận thuộc vòng sơ loại thứ nhất, các đội cũng lần lượt dự vòng sơ loại thứ 2, 3 và loạt play-off (ngày 22 và 29/8) trước khi bước vào vòng bảng.